Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPSEQ9Y251 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms