Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
HDAC5Q9UQL6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms