Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAF8Q9UPN6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms