Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS0

NFU1, NFU1 iron-sulfur cluster scaffold homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFU1Q9UMS0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NFU1Q9UMS0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms