Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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