Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND2AQ9ULE3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND2AQ9ULE3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms