Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRPF3Q9ULD4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRPF3Q9ULD4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms