Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH9Q9ULB4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDH9Q9ULB4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH9Q9ULB4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms