Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VAX2Q9UIW0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms