Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNA3Q9UI47 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms