Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPA4Q9UI42 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms