Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PUF60Q9UHX1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUF60Q9UHX1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms