Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN4Q9UHM6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms