Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG0

DCDC2, Doublecortin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2Q9UHG0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DCDC2Q9UHG0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCDC2Q9UHG0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms