Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPC1L1Q9UHC9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms