Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT8Q9UFF9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms