Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM8A1Q9UBU6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms