Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC6Q9UBN7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDAC6Q9UBN7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC6Q9UBN7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms