Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFNKQ9P0W0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNKQ9P0W0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms