Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PKD2L1Q9P0L9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PKD2L1Q9P0L9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms