Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAPAQ9P0L0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAPAQ9P0L0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms