Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms