Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPG21Q9NZD8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms