Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKIRAS1Q9NYS0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms