Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MIS18AQ9NYP9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms