Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TUBA8Q9NY65 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms