Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms