Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTG1Q9NSN8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms