Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A13Q9NSD5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A13Q9NSD5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A13Q9NSD5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms