Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PAPOLBQ9NRJ5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PAPOLBQ9NRJ5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms