Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INCENPQ9NQS7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms