Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYLDQ9NQC7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLDQ9NQC7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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