Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMMDC1Q9NPL8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms