Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms