Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KIAA1549Q9HCM3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms