Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNRC6CQ9HCJ0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNRC6CQ9HCJ0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms