Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y2

RPF1, Ribosome production factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF1Q9H9Y2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPF1Q9H9Y2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPF1Q9H9Y2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms