Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF39Q9H2S5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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