Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms