Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF541Q9H0D2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms