Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL4Q9C0H6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL4Q9C0H6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms