Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E2

XPO4, Exportin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPO4Q9C0E2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPO4Q9C0E2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPO4Q9C0E2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPO4Q9C0E2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPO4Q9C0E2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPO4Q9C0E2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPO4Q9C0E2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPO4Q9C0E2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms