Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUS3Q9BZE2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUS3Q9BZE2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms