Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms