Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
KRTAP2-4Q9BYR9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms