Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP3-1Q9BYR8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms