Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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