Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NIFKQ9BYG3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIFKQ9BYG3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms