Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY5

CAPS2, Calcyphosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPS2Q9BXY5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPS2Q9BXY5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms