Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNHG12Q9BXW3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms